蓝洞是碳酸盐岩台地中充满海水的巨大垂直洞穴，从空中俯瞰呈现深蓝色圆孔。最著名的伯利兹大蓝洞直径300米、深124米，实为冰河时期形成的石灰岩溶洞。当海平面较低时，雨水渗入石灰岩，溶解形成巨大洞穴。约1.5万年前冰期结束，海平面上升约120米，洞穴被淹没形成蓝洞。其特殊的水体分层结构创造了无氧环境：表层与海洋交换，富氧；深层水流停滞，缺氧且富含硫化氢。这种环境完美保存了远古沉积物和生物遗骸，如同“海洋考古档案”。科学家从中提取的沉积物岩芯，记录了数千年的飓风活动、气候变迁甚至陨石撞击事件。蓝洞也是独特的极端生态系统，其中的微生物可能具有特殊生物活性物质。
